大豆是白质植物性食物中的“奇葩”，它像鱼、大豆蛋白的蛋肉、最好蛋、白质奶等动物性食物一样含有优质蛋白，大豆蛋白的蛋具有较好的最好氨基酸模式，比较符合人体需要，白质营养价值较高。有人认为大豆蛋白与动物蛋白一样好，售卖（大豆）蛋白粉的商家更是宣称大豆蛋白是最好的蛋白质。
其实大豆蛋白虽然算得上优质蛋白，但并非最优质的或最好的。大豆蛋白中一种叫作甲硫氨酸（或蛋氨酸）的必需氨基酸较少，不仅比动物蛋白少，比某些谷类蛋白也少。如果用大豆做饲料喂养禽畜类动物的话，要另外添加一些甲硫氨酸才能满足禽畜类动物的需要。此外，大豆蛋白中赖氨酸也不太稳定，在大豆制品加工过程中有所流失，导致含量不足。因此，大豆蛋白的营养价值比不上牛奶蛋白（乳清蛋白）、鸡蛋蛋白或肉类蛋白。
实际上，大豆的优势并不是蛋白质比动物性食物更好，而是大豆及其制品不含胆固醇，脂肪含量低，且主要为不饱和脂肪酸，这对防治肥胖和高血压、血脂异常、冠心病等心血管病是难得可贵的。为此，1999年，美国食品药品管理局（FDA）允许大豆制品厂商宣称“大豆蛋白可能减少患心脏病的风险”、“作为低饱和脂肪酸和低胆固醇膳食的一部分，每天吃25克大豆蛋白可能减少患心脏病的风险”。
此外，大豆是所有植物性食物中蛋白质含量最多，且质量最好的，并且其中赖氨酸含量丰富，与谷类一起食用能通过互补作用提高整体膳食营养价值。
